MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_12

Total Repeats: 320

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011654	TAG	2	6	13	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011654	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011654	T	7	7	207	213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011654	TGA	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011654	T	6	6	225	230	0 %	100 %	0 %	0 %	217316528
6	NC_011654	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
7	NC_011654	GTT	3	9	303	311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
8	NC_011654	TACT	2	8	344	351	25 %	50 %	0 %	25 %	217316528
9	NC_011654	TCT	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
10	NC_011654	GAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
11	NC_011654	AT	3	6	507	512	50 %	50 %	0 %	0 %	217316528
12	NC_011654	ACT	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316528
13	NC_011654	GAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
14	NC_011654	AATG	2	8	684	691	50 %	25 %	25 %	0 %	217316528
15	NC_011654	TTG	2	6	731	736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
16	NC_011654	ATG	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
17	NC_011654	CAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316528
18	NC_011654	A	7	7	835	841	100 %	0 %	0 %	0 %	217316528
19	NC_011654	T	6	6	894	899	0 %	100 %	0 %	0 %	217316528
20	NC_011654	AAAAAG	2	12	937	948	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316528
21	NC_011654	GAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
22	NC_011654	ATT	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
23	NC_011654	ATT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
24	NC_011654	TAT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
25	NC_011654	AAAAAG	2	12	1031	1042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316528
26	NC_011654	TTC	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
27	NC_011654	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
28	NC_011654	A	6	6	1132	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	217316528
29	NC_011654	AGA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
30	NC_011654	AGA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
31	NC_011654	AAAAGA	2	12	1227	1238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316528
32	NC_011654	A	7	7	1278	1284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011654	ATT	2	6	1287	1292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011654	TAT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011654	AGA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011654	T	6	6	1364	1369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011654	T	7	7	1371	1377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011654	T	6	6	1397	1402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011654	ATT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011654	TAT	2	6	1446	1451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011654	TG	3	6	1466	1471	0 %	50 %	50 %	0 %	217316519
42	NC_011654	GGA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217316519
43	NC_011654	TGAT	2	8	1503	1510	25 %	50 %	25 %	0 %	217316519
44	NC_011654	AGA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
45	NC_011654	GAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
46	NC_011654	TAA	3	9	1609	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
47	NC_011654	TAT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
48	NC_011654	TA	3	6	1634	1639	50 %	50 %	0 %	0 %	217316519
49	NC_011654	A	7	7	1653	1659	100 %	0 %	0 %	0 %	217316519
50	NC_011654	AGAT	2	8	1662	1669	50 %	25 %	25 %	0 %	217316519
51	NC_011654	A	7	7	1741	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	217316519
52	NC_011654	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
53	NC_011654	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
54	NC_011654	TAT	2	6	1786	1791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
55	NC_011654	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
56	NC_011654	GAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
57	NC_011654	GA	3	6	1970	1975	50 %	0 %	50 %	0 %	217316519
58	NC_011654	A	7	7	1980	1986	100 %	0 %	0 %	0 %	217316519
59	NC_011654	AATT	2	8	2004	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	217316519
60	NC_011654	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
61	NC_011654	T	6	6	2072	2077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011654	TAT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011654	TATG	2	8	2092	2099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011654	A	6	6	2212	2217	100 %	0 %	0 %	0 %	217316530
65	NC_011654	AT	3	6	2250	2255	50 %	50 %	0 %	0 %	217316530
66	NC_011654	AAGA	2	8	2266	2273	75 %	0 %	25 %	0 %	217316530
67	NC_011654	TCA	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316530
68	NC_011654	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316530
69	NC_011654	ATA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316530
70	NC_011654	T	9	9	2341	2349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011654	AT	3	6	2354	2359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011654	T	7	7	2374	2380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011654	TCT	2	6	2401	2406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011654	T	6	6	2437	2442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011654	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316518
76	NC_011654	A	6	6	2515	2520	100 %	0 %	0 %	0 %	217316518
77	NC_011654	AG	3	6	2574	2579	50 %	0 %	50 %	0 %	217316518
78	NC_011654	A	6	6	2591	2596	100 %	0 %	0 %	0 %	217316518
79	NC_011654	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316518
80	NC_011654	TGA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316518
81	NC_011654	ATTG	2	8	2715	2722	25 %	50 %	25 %	0 %	217316518
82	NC_011654	TAA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316518
83	NC_011654	A	7	7	2751	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011654	TGAA	2	8	2776	2783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011654	TGT	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011654	ACA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011654	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011654	TAGA	2	8	2924	2931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011654	ATGA	2	8	3032	3039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011654	AGT	2	6	3058	3063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011654	TTA	2	6	3087	3092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011654	CCT	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011654	TTTA	2	8	3141	3148	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011654	TA	3	6	3147	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011654	G	6	6	3159	3164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011654	AGT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011654	CTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316526
98	NC_011654	AG	3	6	3394	3399	50 %	0 %	50 %	0 %	217316526
99	NC_011654	TTG	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316526
100	NC_011654	A	6	6	3475	3480	100 %	0 %	0 %	0 %	217316526
101	NC_011654	GAT	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316526
102	NC_011654	GGA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011654	ATG	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316522
104	NC_011654	GCG	3	9	3631	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217316522
105	NC_011654	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316522
106	NC_011654	AATT	2	8	3703	3710	50 %	50 %	0 %	0 %	217316522
107	NC_011654	TAG	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011654	TA	3	6	3750	3755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011654	AAGGG	2	10	3762	3771	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011654	T	6	6	3789	3794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011654	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316520
112	NC_011654	GTT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
113	NC_011654	TTGG	2	8	3867	3874	0 %	50 %	50 %	0 %	217316520
114	NC_011654	ATTT	2	8	3916	3923	25 %	75 %	0 %	0 %	217316520
115	NC_011654	TGT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
116	NC_011654	AT	3	6	3984	3989	50 %	50 %	0 %	0 %	217316520
117	NC_011654	A	7	7	4012	4018	100 %	0 %	0 %	0 %	217316520
118	NC_011654	A	7	7	4046	4052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011654	TTCA	2	8	4069	4076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011654	GTG	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011654	ATG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
122	NC_011654	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316524
123	NC_011654	TAA	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
124	NC_011654	A	6	6	4376	4381	100 %	0 %	0 %	0 %	217316524
125	NC_011654	TAAAA	2	10	4399	4408	80 %	20 %	0 %	0 %	217316524
126	NC_011654	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
127	NC_011654	TGA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
128	NC_011654	TAA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
129	NC_011654	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217316524
130	NC_011654	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
131	NC_011654	GTA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
132	NC_011654	ATG	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
133	NC_011654	A	6	6	4687	4692	100 %	0 %	0 %	0 %	217316524
134	NC_011654	ATA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
135	NC_011654	GAAA	2	8	4729	4736	75 %	0 %	25 %	0 %	217316524
136	NC_011654	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
137	NC_011654	ACG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217316524
138	NC_011654	TGT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316524
139	NC_011654	TGATT	2	10	4855	4864	20 %	60 %	20 %	0 %	217316524
140	NC_011654	AAG	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
141	NC_011654	AGA	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
142	NC_011654	GAA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
143	NC_011654	CAAG	2	8	5307	5314	50 %	0 %	25 %	25 %	217316524
144	NC_011654	GA	4	8	5363	5370	50 %	0 %	50 %	0 %	217316524
145	NC_011654	GA	3	6	5383	5388	50 %	0 %	50 %	0 %	217316524
146	NC_011654	GA	3	6	5419	5424	50 %	0 %	50 %	0 %	217316524
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182	NC_011654	GGT	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_011654	ATA	2	6	10673	10678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_011654	T	6	6	10687	10692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_011654	TGTT	2	8	10751	10758	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011654	GAT	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316513
282	NC_011654	TGT	2	6	10818	10823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
283	NC_011654	TTG	2	6	10826	10831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
284	NC_011654	TTG	2	6	10848	10853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
285	NC_011654	TGT	2	6	10869	10874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
286	NC_011654	AG	3	6	10905	10910	50 %	0 %	50 %	0 %	217316513
287	NC_011654	ATT	2	6	10932	10937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011654	TATGTA	2	12	11026	11037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011654	T	7	7	11050	11056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011654	AAG	2	6	11087	11092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316521
291	NC_011654	CTT	2	6	11105	11110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316521
292	NC_011654	ATAA	2	8	11169	11176	75 %	25 %	0 %	0 %	217316521
293	NC_011654	A	6	6	11189	11194	100 %	0 %	0 %	0 %	217316515
294	NC_011654	ATT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316515
295	NC_011654	AATTT	2	10	11312	11321	40 %	60 %	0 %	0 %	217316515
296	NC_011654	TGTA	2	8	11368	11375	25 %	50 %	25 %	0 %	217316515
297	NC_011654	TA	4	8	11384	11391	50 %	50 %	0 %	0 %	217316515
298	NC_011654	A	6	6	11404	11409	100 %	0 %	0 %	0 %	217316515
299	NC_011654	TTG	2	6	11486	11491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_011654	AGAAAA	2	12	11517	11528	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217316534
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302	NC_011654	AGA	2	6	11597	11602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316534
303	NC_011654	GAA	2	6	11675	11680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316534
304	NC_011654	GAA	2	6	11696	11701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316534
305	NC_011654	AGT	2	6	11752	11757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
306	NC_011654	AATTTG	2	12	11904	11915	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
307	NC_011654	A	6	6	11992	11997	100 %	0 %	0 %	0 %	217316533
308	NC_011654	TTGAA	2	10	12055	12064	40 %	40 %	20 %	0 %	217316533
309	NC_011654	TCT	2	6	12155	12160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_011654	TTAATA	2	12	12168	12179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_011654	T	6	6	12196	12201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_011654	TATT	2	8	12208	12215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_011654	GAA	2	6	12238	12243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316517
314	NC_011654	GAA	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316517
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317	NC_011654	AAAG	2	8	12395	12402	75 %	0 %	25 %	0 %	217316517
318	NC_011654	ATT	2	6	12410	12415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316517
319	NC_011654	AGT	2	6	12434	12439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316517
320	NC_011654	A	6	6	12468	12473	100 %	0 %	0 %	0 %	217316517

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.